Protein–RNA interactions for Protein: P24530

EDNRB, Endothelin receptor type B, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDNRBP24530 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EDNRBP24530 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
EDNRBP24530 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EDNRBP24530 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDNRBP24530 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDNRBP24530 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDNRBP24530 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDNRBP24530 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
EDNRBP24530 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
EDNRBP24530 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDNRBP24530 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDNRBP24530 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDNRBP24530 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDNRBP24530 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
EDNRBP24530 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
EDNRBP24530 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
EDNRBP24530 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDNRBP24530 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDNRBP24530 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDNRBP24530 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDNRBP24530 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDNRBP24530 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EDNRBP24530 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDNRBP24530 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDNRBP24530 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDNRBP24530 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDNRBP24530 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDNRBP24530 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDNRBP24530 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDNRBP24530 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDNRBP24530 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDNRBP24530 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDNRBP24530 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDNRBP24530 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDNRBP24530 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDNRBP24530 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDNRBP24530 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EDNRBP24530 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EDNRBP24530 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EDNRBP24530 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDNRBP24530 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDNRBP24530 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EDNRBP24530 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EDNRBP24530 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDNRBP24530 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDNRBP24530 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EDNRBP24530 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDNRBP24530 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDNRBP24530 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDNRBP24530 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EDNRBP24530 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EDNRBP24530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDNRBP24530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EDNRBP24530 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EDNRBP24530 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EDNRBP24530 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EDNRBP24530 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EDNRBP24530 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EDNRBP24530 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EDNRBP24530 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EDNRBP24530 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EDNRBP24530 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms