Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP11P24347 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP11P24347 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP11P24347 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP11P24347 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP11P24347 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP11P24347 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP11P24347 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP11P24347 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP11P24347 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP11P24347 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP11P24347 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP11P24347 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP11P24347 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP11P24347 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP11P24347 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP11P24347 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP11P24347 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP11P24347 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP11P24347 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP11P24347 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP11P24347 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP11P24347 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP11P24347 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP11P24347 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP11P24347 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP11P24347 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP11P24347 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP11P24347 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP11P24347 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP11P24347 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP11P24347 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP11P24347 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP11P24347 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMP11P24347 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP11P24347 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP11P24347 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP11P24347 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP11P24347 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP11P24347 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP11P24347 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP11P24347 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP11P24347 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP11P24347 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP11P24347 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP11P24347 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP11P24347 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP11P24347 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP11P24347 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP11P24347 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP11P24347 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP11P24347 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP11P24347 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP11P24347 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP11P24347 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP11P24347 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP11P24347 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP11P24347 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP11P24347 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP11P24347 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP11P24347 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP11P24347 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP11P24347 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP11P24347 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP11P24347 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP11P24347 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP11P24347 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP11P24347 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP11P24347 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP11P24347 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MMP11P24347 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP11P24347 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP11P24347 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP11P24347 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP11P24347 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP11P24347 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP11P24347 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP11P24347 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP11P24347 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP11P24347 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP11P24347 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP11P24347 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP11P24347 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP11P24347 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP11P24347 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP11P24347 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP11P24347 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP11P24347 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP11P24347 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP11P24347 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP11P24347 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP11P24347 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP11P24347 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP11P24347 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP11P24347 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms