Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRR1P24046 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRR1P24046 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR1P24046 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR1P24046 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR1P24046 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRR1P24046 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR1P24046 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR1P24046 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR1P24046 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR1P24046 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR1P24046 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR1P24046 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR1P24046 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR1P24046 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR1P24046 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR1P24046 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRR1P24046 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRR1P24046 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRR1P24046 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR1P24046 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR1P24046 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR1P24046 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR1P24046 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR1P24046 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR1P24046 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRR1P24046 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRR1P24046 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRR1P24046 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms