Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPH2P23942 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPH2P23942 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPH2P23942 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPH2P23942 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRPH2P23942 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPH2P23942 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPH2P23942 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPH2P23942 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPH2P23942 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPH2P23942 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPH2P23942 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPH2P23942 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPH2P23942 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPH2P23942 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPH2P23942 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPH2P23942 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPH2P23942 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPH2P23942 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPH2P23942 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPH2P23942 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPH2P23942 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPH2P23942 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPH2P23942 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPH2P23942 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPH2P23942 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPH2P23942 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPH2P23942 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPH2P23942 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPH2P23942 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPH2P23942 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPH2P23942 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms