Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRDP23468 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRDP23468 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRDP23468 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRDP23468 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRDP23468 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRDP23468 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRDP23468 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRDP23468 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRDP23468 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRDP23468 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRDP23468 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRDP23468 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRDP23468 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRDP23468 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRDP23468 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRDP23468 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRDP23468 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRDP23468 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRDP23468 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRDP23468 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRDP23468 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRDP23468 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRDP23468 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRDP23468 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRDP23468 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRDP23468 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRDP23468 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRDP23468 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRDP23468 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRDP23468 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRDP23468 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRDP23468 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRDP23468 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRDP23468 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRDP23468 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRDP23468 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRDP23468 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRDP23468 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRDP23468 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRDP23468 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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