Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RFX1P22670 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RFX1P22670 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RFX1P22670 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RFX1P22670 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RFX1P22670 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RFX1P22670 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RFX1P22670 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RFX1P22670 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RFX1P22670 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RFX1P22670 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RFX1P22670 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RFX1P22670 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RFX1P22670 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RFX1P22670 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RFX1P22670 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RFX1P22670 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RFX1P22670 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RFX1P22670 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RFX1P22670 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RFX1P22670 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RFX1P22670 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RFX1P22670 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RFX1P22670 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RFX1P22670 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RFX1P22670 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RFX1P22670 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RFX1P22670 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RFX1P22670 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RFX1P22670 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RFX1P22670 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RFX1P22670 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RFX1P22670 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RFX1P22670 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RFX1P22670 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RFX1P22670 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RFX1P22670 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RFX1P22670 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RFX1P22670 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RFX1P22670 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RFX1P22670 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RFX1P22670 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RFX1P22670 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RFX1P22670 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RFX1P22670 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RFX1P22670 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RFX1P22670 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RFX1P22670 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RFX1P22670 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RFX1P22670 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RFX1P22670 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RFX1P22670 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RFX1P22670 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RFX1P22670 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RFX1P22670 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
RFX1P22670 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RFX1P22670 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RFX1P22670 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RFX1P22670 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RFX1P22670 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RFX1P22670 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RFX1P22670 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RFX1P22670 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RFX1P22670 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RFX1P22670 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RFX1P22670 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RFX1P22670 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RFX1P22670 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RFX1P22670 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RFX1P22670 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RFX1P22670 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RFX1P22670 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RFX1P22670 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RFX1P22670 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RFX1P22670 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RFX1P22670 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RFX1P22670 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RFX1P22670 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RFX1P22670 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RFX1P22670 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RFX1P22670 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RFX1P22670 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RFX1P22670 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RFX1P22670 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RFX1P22670 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RFX1P22670 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RFX1P22670 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RFX1P22670 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RFX1P22670 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RFX1P22670 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RFX1P22670 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RFX1P22670 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RFX1P22670 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RFX1P22670 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RFX1P22670 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RFX1P22670 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RFX1P22670 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RFX1P22670 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RFX1P22670 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RFX1P22670 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms