Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK11BP21127 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK11BP21127 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK11BP21127 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK11BP21127 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK11BP21127 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK11BP21127 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK11BP21127 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK11BP21127 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK11BP21127 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK11BP21127 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK11BP21127 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK11BP21127 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK11BP21127 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK11BP21127 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK11BP21127 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK11BP21127 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK11BP21127 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK11BP21127 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK11BP21127 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK11BP21127 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK11BP21127 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK11BP21127 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK11BP21127 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK11BP21127 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK11BP21127 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK11BP21127 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK11BP21127 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CDK11BP21127 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK11BP21127 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK11BP21127 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK11BP21127 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK11BP21127 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK11BP21127 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK11BP21127 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK11BP21127 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK11BP21127 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDK11BP21127 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK11BP21127 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK11BP21127 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK11BP21127 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK11BP21127 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK11BP21127 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms