Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCL3P20749 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCL3P20749 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCL3P20749 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCL3P20749 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL3P20749 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL3P20749 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL3P20749 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL3P20749 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCL3P20749 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCL3P20749 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCL3P20749 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL3P20749 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCL3P20749 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL3P20749 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCL3P20749 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCL3P20749 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCL3P20749 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCL3P20749 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL3P20749 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL3P20749 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL3P20749 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCL3P20749 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCL3P20749 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCL3P20749 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCL3P20749 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCL3P20749 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BCL3P20749 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCL3P20749 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCL3P20749 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCL3P20749 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCL3P20749 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCL3P20749 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCL3P20749 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCL3P20749 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCL3P20749 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCL3P20749 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCL3P20749 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCL3P20749 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCL3P20749 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCL3P20749 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCL3P20749 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCL3P20749 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCL3P20749 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCL3P20749 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCL3P20749 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCL3P20749 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCL3P20749 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCL3P20749 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCL3P20749 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCL3P20749 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCL3P20749 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCL3P20749 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCL3P20749 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCL3P20749 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCL3P20749 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCL3P20749 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCL3P20749 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCL3P20749 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCL3P20749 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCL3P20749 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCL3P20749 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCL3P20749 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCL3P20749 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCL3P20749 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCL3P20749 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCL3P20749 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCL3P20749 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCL3P20749 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCL3P20749 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCL3P20749 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCL3P20749 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCL3P20749 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL3P20749 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL3P20749 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL3P20749 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL3P20749 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL3P20749 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL3P20749 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL3P20749 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL3P20749 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL3P20749 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL3P20749 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCL3P20749 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCL3P20749 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCL3P20749 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCL3P20749 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCL3P20749 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCL3P20749 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCL3P20749 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCL3P20749 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCL3P20749 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCL3P20749 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCL3P20749 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCL3P20749 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCL3P20749 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCL3P20749 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCL3P20749 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCL3P20749 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCL3P20749 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms