Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RXRAP19793 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RXRAP19793 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RXRAP19793 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RXRAP19793 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RXRAP19793 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RXRAP19793 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RXRAP19793 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RXRAP19793 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RXRAP19793 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RXRAP19793 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RXRAP19793 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RXRAP19793 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RXRAP19793 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RXRAP19793 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RXRAP19793 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RXRAP19793 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RXRAP19793 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RXRAP19793 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RXRAP19793 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RXRAP19793 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RXRAP19793 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RXRAP19793 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RXRAP19793 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RXRAP19793 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RXRAP19793 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RXRAP19793 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RXRAP19793 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RXRAP19793 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
RXRAP19793 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RXRAP19793 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RXRAP19793 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RXRAP19793 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RXRAP19793 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RXRAP19793 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RXRAP19793 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RXRAP19793 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRAP19793 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RXRAP19793 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RXRAP19793 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RXRAP19793 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RXRAP19793 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RXRAP19793 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RXRAP19793 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RXRAP19793 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RXRAP19793 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RXRAP19793 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RXRAP19793 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRAP19793 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRAP19793 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RXRAP19793 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RXRAP19793 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RXRAP19793 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RXRAP19793 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RXRAP19793 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RXRAP19793 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RXRAP19793 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RXRAP19793 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RXRAP19793 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RXRAP19793 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RXRAP19793 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RXRAP19793 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RXRAP19793 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RXRAP19793 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RXRAP19793 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RXRAP19793 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RXRAP19793 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RXRAP19793 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RXRAP19793 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RXRAP19793 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RXRAP19793 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RXRAP19793 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RXRAP19793 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RXRAP19793 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RXRAP19793 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RXRAP19793 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RXRAP19793 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RXRAP19793 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RXRAP19793 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RXRAP19793 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RXRAP19793 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RXRAP19793 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RXRAP19793 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RXRAP19793 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RXRAP19793 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RXRAP19793 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RXRAP19793 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RXRAP19793 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RXRAP19793 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RXRAP19793 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RXRAP19793 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RXRAP19793 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RXRAP19793 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RXRAP19793 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RXRAP19793 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RXRAP19793 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RXRAP19793 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RXRAP19793 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RXRAP19793 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RXRAP19793 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms