Protein–RNA interactions for Protein: P17927

CR1, Complement receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1P17927 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CR1P17927 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CR1P17927 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CR1P17927 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CR1P17927 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CR1P17927 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CR1P17927 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CR1P17927 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CR1P17927 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CR1P17927 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CR1P17927 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CR1P17927 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CR1P17927 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CR1P17927 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1P17927 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1P17927 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1P17927 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CR1P17927 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CR1P17927 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CR1P17927 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CR1P17927 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CR1P17927 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CR1P17927 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CR1P17927 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CR1P17927 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CR1P17927 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CR1P17927 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CR1P17927 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CR1P17927 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CR1P17927 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CR1P17927 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CR1P17927 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CR1P17927 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CR1P17927 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CR1P17927 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CR1P17927 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CR1P17927 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CR1P17927 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CR1P17927 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CR1P17927 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CR1P17927 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CR1P17927 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CR1P17927 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CR1P17927 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CR1P17927 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CR1P17927 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CR1P17927 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CR1P17927 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CR1P17927 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CR1P17927 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CR1P17927 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CR1P17927 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CR1P17927 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CR1P17927 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CR1P17927 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CR1P17927 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CR1P17927 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CR1P17927 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CR1P17927 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CR1P17927 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CR1P17927 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CR1P17927 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CR1P17927 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CR1P17927 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CR1P17927 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CR1P17927 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CR1P17927 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CR1P17927 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CR1P17927 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CR1P17927 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CR1P17927 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CR1P17927 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CR1P17927 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CR1P17927 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CR1P17927 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CR1P17927 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CR1P17927 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CR1P17927 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CR1P17927 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CR1P17927 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CR1P17927 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CR1P17927 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CR1P17927 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CR1P17927 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CR1P17927 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CR1P17927 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CR1P17927 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CR1P17927 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CR1P17927 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CR1P17927 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CR1P17927 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CR1P17927 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CR1P17927 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CR1P17927 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CR1P17927 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CR1P17927 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CR1P17927 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CR1P17927 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CR1P17927 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CR1P17927 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms