Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP2A2P16615 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP2A2P16615 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP2A2P16615 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP2A2P16615 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATP2A2P16615 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATP2A2P16615 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP2A2P16615 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP2A2P16615 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP2A2P16615 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP2A2P16615 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP2A2P16615 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP2A2P16615 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATP2A2P16615 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATP2A2P16615 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATP2A2P16615 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ATP2A2P16615 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATP2A2P16615 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ATP2A2P16615 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ATP2A2P16615 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP2A2P16615 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP2A2P16615 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP2A2P16615 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP2A2P16615 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP2A2P16615 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP2A2P16615 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP2A2P16615 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATP2A2P16615 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP2A2P16615 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP2A2P16615 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP2A2P16615 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP2A2P16615 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATP2A2P16615 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ATP2A2P16615 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ATP2A2P16615 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ATP2A2P16615 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP2A2P16615 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ATP2A2P16615 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATP2A2P16615 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP2A2P16615 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP2A2P16615 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP2A2P16615 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2A2P16615 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP2A2P16615 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATP2A2P16615 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP2A2P16615 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP2A2P16615 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP2A2P16615 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP2A2P16615 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP2A2P16615 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2A2P16615 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2A2P16615 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2A2P16615 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2A2P16615 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP2A2P16615 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP2A2P16615 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2A2P16615 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2A2P16615 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2A2P16615 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2A2P16615 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms