Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TSHRP16473 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSHRP16473 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSHRP16473 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSHRP16473 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSHRP16473 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSHRP16473 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSHRP16473 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSHRP16473 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSHRP16473 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSHRP16473 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSHRP16473 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSHRP16473 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSHRP16473 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSHRP16473 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSHRP16473 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSHRP16473 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSHRP16473 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSHRP16473 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSHRP16473 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSHRP16473 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSHRP16473 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TSHRP16473 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSHRP16473 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSHRP16473 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSHRP16473 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSHRP16473 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSHRP16473 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSHRP16473 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSHRP16473 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSHRP16473 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSHRP16473 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSHRP16473 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSHRP16473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSHRP16473 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSHRP16473 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSHRP16473 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSHRP16473 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSHRP16473 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSHRP16473 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSHRP16473 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSHRP16473 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSHRP16473 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSHRP16473 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TSHRP16473 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSHRP16473 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSHRP16473 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSHRP16473 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSHRP16473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSHRP16473 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSHRP16473 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSHRP16473 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSHRP16473 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSHRP16473 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSHRP16473 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSHRP16473 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSHRP16473 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSHRP16473 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSHRP16473 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSHRP16473 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSHRP16473 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSHRP16473 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSHRP16473 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSHRP16473 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSHRP16473 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSHRP16473 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSHRP16473 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSHRP16473 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSHRP16473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSHRP16473 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSHRP16473 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSHRP16473 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSHRP16473 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSHRP16473 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TSHRP16473 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSHRP16473 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSHRP16473 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSHRP16473 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSHRP16473 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSHRP16473 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSHRP16473 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSHRP16473 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSHRP16473 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSHRP16473 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSHRP16473 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSHRP16473 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSHRP16473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSHRP16473 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSHRP16473 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSHRP16473 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSHRP16473 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSHRP16473 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSHRP16473 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSHRP16473 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSHRP16473 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSHRP16473 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSHRP16473 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSHRP16473 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSHRP16473 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSHRP16473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms