Protein–RNA interactions for Protein: P14780

MMP9, Matrix metalloproteinase-9, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP9P14780 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP9P14780 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP9P14780 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP9P14780 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP9P14780 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP9P14780 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP9P14780 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP9P14780 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP9P14780 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP9P14780 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP9P14780 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP9P14780 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP9P14780 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP9P14780 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP9P14780 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP9P14780 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP9P14780 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP9P14780 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP9P14780 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP9P14780 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP9P14780 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP9P14780 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP9P14780 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP9P14780 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP9P14780 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP9P14780 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP9P14780 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP9P14780 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP9P14780 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP9P14780 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP9P14780 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP9P14780 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP9P14780 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP9P14780 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP9P14780 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP9P14780 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP9P14780 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP9P14780 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP9P14780 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP9P14780 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP9P14780 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP9P14780 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP9P14780 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP9P14780 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP9P14780 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP9P14780 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP9P14780 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP9P14780 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP9P14780 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP9P14780 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP9P14780 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP9P14780 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP9P14780 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP9P14780 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP9P14780 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP9P14780 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP9P14780 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP9P14780 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP9P14780 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP9P14780 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP9P14780 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP9P14780 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP9P14780 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP9P14780 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP9P14780 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP9P14780 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP9P14780 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP9P14780 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP9P14780 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP9P14780 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP9P14780 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP9P14780 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP9P14780 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP9P14780 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP9P14780 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP9P14780 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP9P14780 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP9P14780 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP9P14780 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP9P14780 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP9P14780 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP9P14780 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP9P14780 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP9P14780 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP9P14780 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP9P14780 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP9P14780 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP9P14780 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP9P14780 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP9P14780 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP9P14780 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP9P14780 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP9P14780 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP9P14780 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP9P14780 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP9P14780 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP9P14780 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP9P14780 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP9P14780 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP9P14780 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms