Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGF3P11487 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGF3P11487 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGF3P11487 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGF3P11487 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGF3P11487 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FGF3P11487 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGF3P11487 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGF3P11487 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGF3P11487 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FGF3P11487 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGF3P11487 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGF3P11487 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGF3P11487 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGF3P11487 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGF3P11487 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGF3P11487 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGF3P11487 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGF3P11487 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGF3P11487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGF3P11487 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGF3P11487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGF3P11487 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGF3P11487 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGF3P11487 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGF3P11487 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGF3P11487 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGF3P11487 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGF3P11487 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGF3P11487 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGF3P11487 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGF3P11487 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGF3P11487 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGF3P11487 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGF3P11487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGF3P11487 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGF3P11487 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGF3P11487 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGF3P11487 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGF3P11487 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGF3P11487 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGF3P11487 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGF3P11487 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGF3P11487 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGF3P11487 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGF3P11487 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGF3P11487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FGF3P11487 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGF3P11487 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGF3P11487 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGF3P11487 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGF3P11487 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGF3P11487 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGF3P11487 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGF3P11487 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGF3P11487 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGF3P11487 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGF3P11487 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGF3P11487 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGF3P11487 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGF3P11487 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGF3P11487 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGF3P11487 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGF3P11487 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGF3P11487 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGF3P11487 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGF3P11487 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGF3P11487 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGF3P11487 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGF3P11487 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FGF3P11487 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGF3P11487 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGF3P11487 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGF3P11487 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGF3P11487 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGF3P11487 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGF3P11487 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGF3P11487 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGF3P11487 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGF3P11487 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGF3P11487 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGF3P11487 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGF3P11487 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FGF3P11487 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
FGF3P11487 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGF3P11487 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGF3P11487 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGF3P11487 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGF3P11487 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGF3P11487 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGF3P11487 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGF3P11487 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGF3P11487 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGF3P11487 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGF3P11487 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGF3P11487 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FGF3P11487 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGF3P11487 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGF3P11487 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGF3P11487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms