Protein–RNA interactions for Protein: P11310

ACADM, Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADMP11310 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACADMP11310 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACADMP11310 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACADMP11310 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACADMP11310 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACADMP11310 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ACADMP11310 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACADMP11310 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACADMP11310 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACADMP11310 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACADMP11310 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACADMP11310 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACADMP11310 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACADMP11310 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACADMP11310 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACADMP11310 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACADMP11310 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACADMP11310 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACADMP11310 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACADMP11310 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACADMP11310 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACADMP11310 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACADMP11310 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACADMP11310 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACADMP11310 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACADMP11310 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACADMP11310 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACADMP11310 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACADMP11310 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ACADMP11310 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACADMP11310 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACADMP11310 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACADMP11310 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACADMP11310 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACADMP11310 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACADMP11310 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACADMP11310 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACADMP11310 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACADMP11310 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACADMP11310 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACADMP11310 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACADMP11310 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACADMP11310 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACADMP11310 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACADMP11310 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACADMP11310 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACADMP11310 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACADMP11310 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACADMP11310 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACADMP11310 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACADMP11310 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACADMP11310 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACADMP11310 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ACADMP11310 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACADMP11310 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACADMP11310 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ACADMP11310 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ACADMP11310 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACADMP11310 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACADMP11310 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACADMP11310 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACADMP11310 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACADMP11310 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACADMP11310 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACADMP11310 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACADMP11310 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADMP11310 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADMP11310 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ACADMP11310 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACADMP11310 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACADMP11310 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADMP11310 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADMP11310 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADMP11310 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACADMP11310 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADMP11310 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADMP11310 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACADMP11310 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACADMP11310 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACADMP11310 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACADMP11310 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACADMP11310 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACADMP11310 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACADMP11310 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACADMP11310 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACADMP11310 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ACADMP11310 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACADMP11310 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACADMP11310 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACADMP11310 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACADMP11310 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACADMP11310 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADMP11310 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACADMP11310 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACADMP11310 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACADMP11310 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACADMP11310 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACADMP11310 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACADMP11310 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACADMP11310 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms