Protein–RNA interactions for Protein: P10412

HIST1H1E, Histone H1.4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1EP10412 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H1EP10412 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H1EP10412 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST1H1EP10412 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H1EP10412 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H1EP10412 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H1EP10412 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H1EP10412 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H1EP10412 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H1EP10412 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H1EP10412 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H1EP10412 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST1H1EP10412 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIST1H1EP10412 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIST1H1EP10412 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST1H1EP10412 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST1H1EP10412 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST1H1EP10412 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST1H1EP10412 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms