Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV1-8P0DP01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV1-8P0DP01 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV1-8P0DP01 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV1-8P0DP01 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV1-8P0DP01 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV1-8P0DP01 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV1-8P0DP01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV1-8P0DP01 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV1-8P0DP01 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV1-8P0DP01 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV1-8P0DP01 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV1-8P0DP01 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV1-8P0DP01 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV1-8P0DP01 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV1-8P0DP01 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV1-8P0DP01 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV1-8P0DP01 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHV1-8P0DP01 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV1-8P0DP01 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-8P0DP01 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV1-8P0DP01 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV1-8P0DP01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV1-8P0DP01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms