Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPBGLP0DKB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPBGLP0DKB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TPBGLP0DKB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPBGLP0DKB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPBGLP0DKB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPBGLP0DKB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TPBGLP0DKB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPBGLP0DKB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPBGLP0DKB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPBGLP0DKB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPBGLP0DKB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPBGLP0DKB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPBGLP0DKB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPBGLP0DKB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPBGLP0DKB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TPBGLP0DKB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPBGLP0DKB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPBGLP0DKB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPBGLP0DKB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPBGLP0DKB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPBGLP0DKB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPBGLP0DKB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPBGLP0DKB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPBGLP0DKB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPBGLP0DKB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPBGLP0DKB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPBGLP0DKB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPBGLP0DKB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPBGLP0DKB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPBGLP0DKB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPBGLP0DKB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPBGLP0DKB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPBGLP0DKB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms