Protein–RNA interactions for Protein: P05451

REG1A, Lithostathine-1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1AP05451 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REG1AP05451 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REG1AP05451 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REG1AP05451 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REG1AP05451 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REG1AP05451 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REG1AP05451 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REG1AP05451 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REG1AP05451 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REG1AP05451 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REG1AP05451 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
REG1AP05451 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REG1AP05451 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REG1AP05451 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REG1AP05451 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REG1AP05451 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REG1AP05451 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REG1AP05451 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REG1AP05451 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REG1AP05451 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REG1AP05451 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REG1AP05451 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REG1AP05451 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REG1AP05451 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REG1AP05451 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REG1AP05451 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REG1AP05451 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REG1AP05451 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REG1AP05451 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REG1AP05451 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REG1AP05451 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REG1AP05451 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REG1AP05451 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REG1AP05451 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REG1AP05451 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REG1AP05451 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REG1AP05451 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
REG1AP05451 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REG1AP05451 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REG1AP05451 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REG1AP05451 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REG1AP05451 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REG1AP05451 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REG1AP05451 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REG1AP05451 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REG1AP05451 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REG1AP05451 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REG1AP05451 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REG1AP05451 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REG1AP05451 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REG1AP05451 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REG1AP05451 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REG1AP05451 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REG1AP05451 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REG1AP05451 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REG1AP05451 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REG1AP05451 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REG1AP05451 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REG1AP05451 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REG1AP05451 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REG1AP05451 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REG1AP05451 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REG1AP05451 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REG1AP05451 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REG1AP05451 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REG1AP05451 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REG1AP05451 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REG1AP05451 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REG1AP05451 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REG1AP05451 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REG1AP05451 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REG1AP05451 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REG1AP05451 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REG1AP05451 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REG1AP05451 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REG1AP05451 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REG1AP05451 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REG1AP05451 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REG1AP05451 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REG1AP05451 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REG1AP05451 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REG1AP05451 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REG1AP05451 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REG1AP05451 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REG1AP05451 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REG1AP05451 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REG1AP05451 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REG1AP05451 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REG1AP05451 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REG1AP05451 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REG1AP05451 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REG1AP05451 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REG1AP05451 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REG1AP05451 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REG1AP05451 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REG1AP05451 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REG1AP05451 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REG1AP05451 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REG1AP05451 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REG1AP05451 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms