Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB3P05106 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB3P05106 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITGB3P05106 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB3P05106 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB3P05106 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGB3P05106 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGB3P05106 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGB3P05106 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB3P05106 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGB3P05106 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGB3P05106 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB3P05106 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGB3P05106 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB3P05106 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGB3P05106 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3P05106 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGB3P05106 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ITGB3P05106 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB3P05106 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB3P05106 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB3P05106 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGB3P05106 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB3P05106 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB3P05106 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB3P05106 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB3P05106 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB3P05106 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB3P05106 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB3P05106 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB3P05106 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB3P05106 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB3P05106 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3P05106 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3P05106 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms