Protein–RNA interactions for Protein: P04001

OPN1MW, Medium-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MWP04001 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1MWP04001 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1MWP04001 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPN1MWP04001 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1MWP04001 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1MWP04001 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1MWP04001 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1MWP04001 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1MWP04001 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1MWP04001 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1MWP04001 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPN1MWP04001 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPN1MWP04001 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPN1MWP04001 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPN1MWP04001 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1MWP04001 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1MWP04001 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1MWP04001 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPN1MWP04001 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1MWP04001 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1MWP04001 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1MWP04001 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1MWP04001 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1MWP04001 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1MWP04001 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1MWP04001 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms