Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APOC2P02655 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APOC2P02655 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOC2P02655 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APOC2P02655 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOC2P02655 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOC2P02655 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOC2P02655 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOC2P02655 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOC2P02655 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOC2P02655 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOC2P02655 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOC2P02655 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOC2P02655 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOC2P02655 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOC2P02655 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOC2P02655 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APOC2P02655 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOC2P02655 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOC2P02655 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOC2P02655 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOC2P02655 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOC2P02655 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOC2P02655 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
APOC2P02655 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOC2P02655 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOC2P02655 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOC2P02655 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOC2P02655 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOC2P02655 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOC2P02655 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOC2P02655 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOC2P02655 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOC2P02655 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOC2P02655 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APOC2P02655 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOC2P02655 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOC2P02655 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOC2P02655 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOC2P02655 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOC2P02655 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOC2P02655 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOC2P02655 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOC2P02655 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOC2P02655 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOC2P02655 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOC2P02655 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOC2P02655 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOC2P02655 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOC2P02655 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APOC2P02655 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOC2P02655 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APOC2P02655 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOC2P02655 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOC2P02655 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOC2P02655 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOC2P02655 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOC2P02655 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOC2P02655 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOC2P02655 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOC2P02655 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOC2P02655 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOC2P02655 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOC2P02655 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOC2P02655 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOC2P02655 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOC2P02655 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOC2P02655 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOC2P02655 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOC2P02655 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOC2P02655 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOC2P02655 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOC2P02655 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOC2P02655 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOC2P02655 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOC2P02655 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOC2P02655 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOC2P02655 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOC2P02655 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOC2P02655 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOC2P02655 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
APOC2P02655 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOC2P02655 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOC2P02655 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOC2P02655 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOC2P02655 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOC2P02655 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOC2P02655 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOC2P02655 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOC2P02655 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOC2P02655 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOC2P02655 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOC2P02655 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOC2P02655 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOC2P02655 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOC2P02655 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOC2P02655 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOC2P02655 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOC2P02655 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOC2P02655 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms