Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD8AP01732 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD8AP01732 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8AP01732 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8AP01732 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8AP01732 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8AP01732 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8AP01732 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD8AP01732 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8AP01732 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8AP01732 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD8AP01732 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD8AP01732 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CD8AP01732 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD8AP01732 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD8AP01732 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD8AP01732 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8AP01732 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD8AP01732 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD8AP01732 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD8AP01732 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8AP01732 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD8AP01732 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD8AP01732 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD8AP01732 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD8AP01732 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD8AP01732 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD8AP01732 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8AP01732 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8AP01732 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD8AP01732 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8AP01732 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD8AP01732 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD8AP01732 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD8AP01732 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD8AP01732 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD8AP01732 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8AP01732 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD8AP01732 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8AP01732 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD8AP01732 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8AP01732 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8AP01732 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD8AP01732 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD8AP01732 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD8AP01732 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD8AP01732 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD8AP01732 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8AP01732 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8AP01732 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8AP01732 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8AP01732 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8AP01732 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8AP01732 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD8AP01732 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD8AP01732 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD8AP01732 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD8AP01732 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8AP01732 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8AP01732 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8AP01732 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8AP01732 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8AP01732 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8AP01732 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8AP01732 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8AP01732 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD8AP01732 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD8AP01732 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD8AP01732 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD8AP01732 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD8AP01732 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD8AP01732 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD8AP01732 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8AP01732 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD8AP01732 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8AP01732 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8AP01732 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD8AP01732 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD8AP01732 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD8AP01732 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD8AP01732 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8AP01732 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD8AP01732 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD8AP01732 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8AP01732 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8AP01732 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8AP01732 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8AP01732 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8AP01732 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD8AP01732 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD8AP01732 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD8AP01732 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8AP01732 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8AP01732 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD8AP01732 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD8AP01732 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD8AP01732 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8AP01732 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8AP01732 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD8AP01732 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms