Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFRP00374 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFRP00374 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DHFRP00374 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHFRP00374 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHFRP00374 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHFRP00374 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHFRP00374 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHFRP00374 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHFRP00374 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHFRP00374 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHFRP00374 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHFRP00374 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHFRP00374 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHFRP00374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFRP00374 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHFRP00374 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHFRP00374 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHFRP00374 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHFRP00374 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFRP00374 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFRP00374 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHFRP00374 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFRP00374 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHFRP00374 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHFRP00374 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFRP00374 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFRP00374 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFRP00374 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFRP00374 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFRP00374 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHFRP00374 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHFRP00374 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHFRP00374 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHFRP00374 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFRP00374 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHFRP00374 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHFRP00374 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFRP00374 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHFRP00374 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHFRP00374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHFRP00374 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHFRP00374 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHFRP00374 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHFRP00374 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHFRP00374 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHFRP00374 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHFRP00374 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHFRP00374 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHFRP00374 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHFRP00374 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHFRP00374 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHFRP00374 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHFRP00374 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DHFRP00374 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHFRP00374 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHFRP00374 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHFRP00374 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHFRP00374 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHFRP00374 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHFRP00374 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHFRP00374 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHFRP00374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHFRP00374 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHFRP00374 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHFRP00374 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHFRP00374 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHFRP00374 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHFRP00374 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHFRP00374 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHFRP00374 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHFRP00374 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHFRP00374 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHFRP00374 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHFRP00374 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHFRP00374 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHFRP00374 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHFRP00374 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFRP00374 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFRP00374 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFRP00374 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHFRP00374 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHFRP00374 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHFRP00374 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFRP00374 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFRP00374 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHFRP00374 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHFRP00374 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHFRP00374 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHFRP00374 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHFRP00374 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHFRP00374 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHFRP00374 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHFRP00374 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHFRP00374 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHFRP00374 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFRP00374 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFRP00374 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHFRP00374 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHFRP00374 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms