Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLPTM1O96005 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLPTM1O96005 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLPTM1O96005 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLPTM1O96005 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLPTM1O96005 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLPTM1O96005 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLPTM1O96005 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLPTM1O96005 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLPTM1O96005 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLPTM1O96005 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLPTM1O96005 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLPTM1O96005 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLPTM1O96005 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPTM1O96005 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPTM1O96005 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1O96005 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1O96005 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPTM1O96005 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPTM1O96005 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPTM1O96005 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPTM1O96005 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLPTM1O96005 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPTM1O96005 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLPTM1O96005 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1O96005 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLPTM1O96005 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLPTM1O96005 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLPTM1O96005 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLPTM1O96005 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPTM1O96005 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms