Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3DO95716 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3DO95716 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3DO95716 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3DO95716 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3DO95716 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3DO95716 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3DO95716 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3DO95716 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3DO95716 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3DO95716 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3DO95716 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3DO95716 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3DO95716 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3DO95716 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3DO95716 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3DO95716 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3DO95716 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3DO95716 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3DO95716 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3DO95716 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB3DO95716 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3DO95716 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3DO95716 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3DO95716 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3DO95716 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3DO95716 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3DO95716 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3DO95716 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB3DO95716 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3DO95716 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3DO95716 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3DO95716 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms