Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAF4O95104 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF4O95104 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAF4O95104 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAF4O95104 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF4O95104 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAF4O95104 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF4O95104 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF4O95104 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF4O95104 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF4O95104 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAF4O95104 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAF4O95104 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF4O95104 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF4O95104 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAF4O95104 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF4O95104 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms