Protein–RNA interactions for Protein: O95070

YIF1A, Protein YIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1AO95070 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIF1AO95070 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIF1AO95070 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIF1AO95070 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIF1AO95070 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIF1AO95070 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIF1AO95070 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIF1AO95070 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIF1AO95070 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIF1AO95070 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIF1AO95070 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIF1AO95070 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIF1AO95070 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIF1AO95070 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIF1AO95070 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIF1AO95070 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIF1AO95070 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIF1AO95070 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1AO95070 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1AO95070 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1AO95070 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1AO95070 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1AO95070 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1AO95070 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIF1AO95070 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIF1AO95070 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms