Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLPXO76031 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPXO76031 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPXO76031 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPXO76031 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPXO76031 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPXO76031 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPXO76031 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPXO76031 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPXO76031 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPXO76031 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPXO76031 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLPXO76031 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPXO76031 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLPXO76031 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLPXO76031 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLPXO76031 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPXO76031 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLPXO76031 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLPXO76031 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPXO76031 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLPXO76031 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPXO76031 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLPXO76031 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPXO76031 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPXO76031 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPXO76031 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPXO76031 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLPXO76031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLPXO76031 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPXO76031 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLPXO76031 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPXO76031 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPXO76031 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPXO76031 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPXO76031 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLPXO76031 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPXO76031 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPXO76031 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPXO76031 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPXO76031 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPXO76031 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPXO76031 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPXO76031 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPXO76031 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPXO76031 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLPXO76031 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPXO76031 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPXO76031 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPXO76031 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLPXO76031 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLPXO76031 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLPXO76031 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLPXO76031 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLPXO76031 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLPXO76031 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLPXO76031 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLPXO76031 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPXO76031 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPXO76031 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPXO76031 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLPXO76031 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLPXO76031 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLPXO76031 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLPXO76031 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPXO76031 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPXO76031 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPXO76031 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPXO76031 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPXO76031 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPXO76031 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLPXO76031 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLPXO76031 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPXO76031 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPXO76031 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPXO76031 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLPXO76031 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPXO76031 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPXO76031 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLPXO76031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPXO76031 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPXO76031 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPXO76031 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPXO76031 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPXO76031 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPXO76031 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLPXO76031 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPXO76031 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPXO76031 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPXO76031 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPXO76031 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPXO76031 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPXO76031 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPXO76031 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPXO76031 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPXO76031 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPXO76031 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPXO76031 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPXO76031 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPXO76031 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms