Protein–RNA interactions for Protein: O75934

BCAS2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS2O75934 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS2O75934 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCAS2O75934 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAS2O75934 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAS2O75934 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAS2O75934 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS2O75934 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAS2O75934 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAS2O75934 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAS2O75934 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS2O75934 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAS2O75934 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAS2O75934 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS2O75934 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS2O75934 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS2O75934 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS2O75934 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS2O75934 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAS2O75934 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS2O75934 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS2O75934 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS2O75934 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS2O75934 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS2O75934 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS2O75934 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS2O75934 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS2O75934 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS2O75934 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS2O75934 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS2O75934 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS2O75934 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS2O75934 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAS2O75934 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS2O75934 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS2O75934 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS2O75934 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS2O75934 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS2O75934 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAS2O75934 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCAS2O75934 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS2O75934 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms