Protein–RNA interactions for Protein: O75556

SCGB2A1, Mammaglobin-B, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A1O75556 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB2A1O75556 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB2A1O75556 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGB2A1O75556 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB2A1O75556 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB2A1O75556 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB2A1O75556 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB2A1O75556 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB2A1O75556 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB2A1O75556 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB2A1O75556 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB2A1O75556 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB2A1O75556 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGB2A1O75556 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB2A1O75556 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCGB2A1O75556 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB2A1O75556 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB2A1O75556 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB2A1O75556 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB2A1O75556 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB2A1O75556 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB2A1O75556 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGB2A1O75556 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGB2A1O75556 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB2A1O75556 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGB2A1O75556 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB2A1O75556 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCGB2A1O75556 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCGB2A1O75556 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB2A1O75556 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB2A1O75556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB2A1O75556 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB2A1O75556 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A1O75556 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A1O75556 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB2A1O75556 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms