Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA2O75334 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA2O75334 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA2O75334 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA2O75334 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA2O75334 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA2O75334 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA2O75334 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA2O75334 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA2O75334 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA2O75334 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA2O75334 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA2O75334 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA2O75334 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA2O75334 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA2O75334 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA2O75334 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA2O75334 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA2O75334 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPFIA2O75334 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA2O75334 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA2O75334 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA2O75334 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA2O75334 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA2O75334 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPFIA2O75334 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA2O75334 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA2O75334 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA2O75334 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPFIA2O75334 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA2O75334 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms