Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDH16O75309 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDH16O75309 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDH16O75309 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDH16O75309 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDH16O75309 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDH16O75309 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDH16O75309 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDH16O75309 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDH16O75309 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDH16O75309 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDH16O75309 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDH16O75309 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDH16O75309 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDH16O75309 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH16O75309 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDH16O75309 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDH16O75309 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDH16O75309 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDH16O75309 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDH16O75309 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDH16O75309 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDH16O75309 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH16O75309 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH16O75309 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDH16O75309 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDH16O75309 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDH16O75309 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDH16O75309 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDH16O75309 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDH16O75309 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDH16O75309 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDH16O75309 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDH16O75309 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDH16O75309 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDH16O75309 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDH16O75309 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDH16O75309 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDH16O75309 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH16O75309 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH16O75309 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH16O75309 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH16O75309 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDH16O75309 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDH16O75309 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH16O75309 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH16O75309 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH16O75309 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDH16O75309 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH16O75309 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH16O75309 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH16O75309 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH16O75309 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH16O75309 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH16O75309 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDH16O75309 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH16O75309 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH16O75309 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH16O75309 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH16O75309 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH16O75309 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH16O75309 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH16O75309 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH16O75309 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH16O75309 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDH16O75309 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH16O75309 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH16O75309 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH16O75309 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH16O75309 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH16O75309 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDH16O75309 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH16O75309 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDH16O75309 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH16O75309 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH16O75309 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH16O75309 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH16O75309 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH16O75309 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH16O75309 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH16O75309 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH16O75309 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH16O75309 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH16O75309 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH16O75309 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH16O75309 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH16O75309 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH16O75309 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH16O75309 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH16O75309 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH16O75309 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH16O75309 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH16O75309 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH16O75309 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH16O75309 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH16O75309 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH16O75309 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH16O75309 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH16O75309 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH16O75309 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms