Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT3O75175 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT3O75175 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT3O75175 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT3O75175 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT3O75175 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT3O75175 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT3O75175 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT3O75175 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT3O75175 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNOT3O75175 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNOT3O75175 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT3O75175 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNOT3O75175 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNOT3O75175 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNOT3O75175 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNOT3O75175 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNOT3O75175 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT3O75175 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT3O75175 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT3O75175 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT3O75175 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT3O75175 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT3O75175 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT3O75175 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT3O75175 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT3O75175 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT3O75175 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT3O75175 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT3O75175 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT3O75175 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT3O75175 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT3O75175 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT3O75175 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT3O75175 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNOT3O75175 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT3O75175 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT3O75175 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT3O75175 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNOT3O75175 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNOT3O75175 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT3O75175 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms