Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN2BO60939 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN2BO60939 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN2BO60939 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN2BO60939 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN2BO60939 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN2BO60939 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN2BO60939 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN2BO60939 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN2BO60939 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN2BO60939 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN2BO60939 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN2BO60939 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN2BO60939 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN2BO60939 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN2BO60939 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN2BO60939 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN2BO60939 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN2BO60939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN2BO60939 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN2BO60939 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN2BO60939 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN2BO60939 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN2BO60939 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN2BO60939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN2BO60939 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN2BO60939 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms