Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINK4O60575 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPINK4O60575 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPINK4O60575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPINK4O60575 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPINK4O60575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPINK4O60575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPINK4O60575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPINK4O60575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPINK4O60575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPINK4O60575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPINK4O60575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINK4O60575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINK4O60575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINK4O60575 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINK4O60575 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINK4O60575 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINK4O60575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPINK4O60575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINK4O60575 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPINK4O60575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPINK4O60575 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPINK4O60575 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPINK4O60575 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPINK4O60575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPINK4O60575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPINK4O60575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINK4O60575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPINK4O60575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPINK4O60575 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms