Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFNA2O43921 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFNA2O43921 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFNA2O43921 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFNA2O43921 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFNA2O43921 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFNA2O43921 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFNA2O43921 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFNA2O43921 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFNA2O43921 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFNA2O43921 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFNA2O43921 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFNA2O43921 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFNA2O43921 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFNA2O43921 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFNA2O43921 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFNA2O43921 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFNA2O43921 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EFNA2O43921 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFNA2O43921 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFNA2O43921 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFNA2O43921 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFNA2O43921 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFNA2O43921 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
EFNA2O43921 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFNA2O43921 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFNA2O43921 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFNA2O43921 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNA2O43921 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFNA2O43921 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms