Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRKAB2O43741 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKAB2O43741 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRKAB2O43741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKAB2O43741 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRKAB2O43741 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRKAB2O43741 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKAB2O43741 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRKAB2O43741 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PRKAB2O43741 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRKAB2O43741 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRKAB2O43741 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRKAB2O43741 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRKAB2O43741 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRKAB2O43741 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRKAB2O43741 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRKAB2O43741 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRKAB2O43741 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRKAB2O43741 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRKAB2O43741 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRKAB2O43741 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRKAB2O43741 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRKAB2O43741 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRKAB2O43741 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRKAB2O43741 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRKAB2O43741 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRKAB2O43741 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRKAB2O43741 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRKAB2O43741 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRKAB2O43741 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRKAB2O43741 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PRKAB2O43741 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PRKAB2O43741 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRKAB2O43741 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKAB2O43741 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKAB2O43741 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PRKAB2O43741 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRKAB2O43741 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PRKAB2O43741 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRKAB2O43741 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKAB2O43741 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKAB2O43741 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKAB2O43741 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRKAB2O43741 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRKAB2O43741 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRKAB2O43741 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRKAB2O43741 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PRKAB2O43741 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRKAB2O43741 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms