Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATCO43716 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATCO43716 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATCO43716 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATCO43716 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATCO43716 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATCO43716 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATCO43716 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATCO43716 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATCO43716 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATCO43716 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATCO43716 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATCO43716 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATCO43716 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATCO43716 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATCO43716 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATCO43716 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATCO43716 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATCO43716 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATCO43716 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATCO43716 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATCO43716 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATCO43716 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATCO43716 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATCO43716 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATCO43716 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATCO43716 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATCO43716 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATCO43716 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATCO43716 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATCO43716 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATCO43716 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATCO43716 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATCO43716 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATCO43716 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATCO43716 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATCO43716 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATCO43716 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATCO43716 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATCO43716 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATCO43716 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATCO43716 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATCO43716 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATCO43716 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATCO43716 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATCO43716 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATCO43716 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATCO43716 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATCO43716 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATCO43716 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATCO43716 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATCO43716 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATCO43716 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATCO43716 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATCO43716 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATCO43716 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATCO43716 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATCO43716 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATCO43716 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATCO43716 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GATCO43716 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GATCO43716 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATCO43716 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GATCO43716 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATCO43716 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GATCO43716 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GATCO43716 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATCO43716 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATCO43716 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GATCO43716 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATCO43716 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GATCO43716 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATCO43716 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATCO43716 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATCO43716 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GATCO43716 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATCO43716 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATCO43716 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GATCO43716 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATCO43716 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATCO43716 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATCO43716 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATCO43716 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATCO43716 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATCO43716 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATCO43716 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATCO43716 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATCO43716 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATCO43716 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATCO43716 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATCO43716 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATCO43716 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATCO43716 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATCO43716 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATCO43716 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATCO43716 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GATCO43716 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATCO43716 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GATCO43716 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GATCO43716 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms