Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGOLN2O43493 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGOLN2O43493 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGOLN2O43493 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGOLN2O43493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGOLN2O43493 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGOLN2O43493 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TGOLN2O43493 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGOLN2O43493 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGOLN2O43493 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGOLN2O43493 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TGOLN2O43493 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGOLN2O43493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGOLN2O43493 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGOLN2O43493 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGOLN2O43493 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGOLN2O43493 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGOLN2O43493 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGOLN2O43493 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGOLN2O43493 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGOLN2O43493 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGOLN2O43493 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGOLN2O43493 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGOLN2O43493 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGOLN2O43493 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGOLN2O43493 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGOLN2O43493 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGOLN2O43493 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGOLN2O43493 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGOLN2O43493 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms