Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FABP7O15540 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FABP7O15540 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FABP7O15540 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FABP7O15540 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FABP7O15540 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FABP7O15540 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FABP7O15540 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FABP7O15540 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FABP7O15540 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FABP7O15540 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FABP7O15540 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FABP7O15540 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FABP7O15540 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FABP7O15540 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FABP7O15540 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FABP7O15540 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FABP7O15540 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FABP7O15540 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FABP7O15540 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FABP7O15540 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FABP7O15540 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FABP7O15540 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FABP7O15540 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FABP7O15540 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FABP7O15540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FABP7O15540 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FABP7O15540 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FABP7O15540 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FABP7O15540 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FABP7O15540 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FABP7O15540 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FABP7O15540 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FABP7O15540 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FABP7O15540 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FABP7O15540 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FABP7O15540 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FABP7O15540 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FABP7O15540 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FABP7O15540 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FABP7O15540 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FABP7O15540 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FABP7O15540 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FABP7O15540 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FABP7O15540 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FABP7O15540 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FABP7O15540 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FABP7O15540 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FABP7O15540 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FABP7O15540 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FABP7O15540 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FABP7O15540 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FABP7O15540 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FABP7O15540 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FABP7O15540 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FABP7O15540 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FABP7O15540 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FABP7O15540 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FABP7O15540 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FABP7O15540 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FABP7O15540 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FABP7O15540 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FABP7O15540 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FABP7O15540 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FABP7O15540 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FABP7O15540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FABP7O15540 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FABP7O15540 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FABP7O15540 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FABP7O15540 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FABP7O15540 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FABP7O15540 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FABP7O15540 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FABP7O15540 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FABP7O15540 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FABP7O15540 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FABP7O15540 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FABP7O15540 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FABP7O15540 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FABP7O15540 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FABP7O15540 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FABP7O15540 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FABP7O15540 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FABP7O15540 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FABP7O15540 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FABP7O15540 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FABP7O15540 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FABP7O15540 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FABP7O15540 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FABP7O15540 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FABP7O15540 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FABP7O15540 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FABP7O15540 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FABP7O15540 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FABP7O15540 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FABP7O15540 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FABP7O15540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FABP7O15540 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FABP7O15540 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FABP7O15540 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms