Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CEP290O15078 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP290O15078 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP290O15078 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP290O15078 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP290O15078 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP290O15078 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP290O15078 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP290O15078 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CEP290O15078 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CEP290O15078 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CEP290O15078 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CEP290O15078 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CEP290O15078 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CEP290O15078 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CEP290O15078 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CEP290O15078 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP290O15078 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP290O15078 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP290O15078 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CEP290O15078 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP290O15078 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CEP290O15078 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP290O15078 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP290O15078 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP290O15078 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP290O15078 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP290O15078 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP290O15078 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP290O15078 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CEP290O15078 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CEP290O15078 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CEP290O15078 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CEP290O15078 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CEP290O15078 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CEP290O15078 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CEP290O15078 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CEP290O15078 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CEP290O15078 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CEP290O15078 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CEP290O15078 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CEP290O15078 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CEP290O15078 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CEP290O15078 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP290O15078 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP290O15078 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP290O15078 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP290O15078 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP290O15078 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP290O15078 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP290O15078 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP290O15078 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP290O15078 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP290O15078 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP290O15078 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP290O15078 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP290O15078 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP290O15078 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP290O15078 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP290O15078 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP290O15078 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP290O15078 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP290O15078 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP290O15078 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP290O15078 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP290O15078 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP290O15078 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP290O15078 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP290O15078 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP290O15078 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP290O15078 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CEP290O15078 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP290O15078 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CEP290O15078 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CEP290O15078 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP290O15078 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP290O15078 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CEP290O15078 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP290O15078 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CEP290O15078 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP290O15078 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP290O15078 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CEP290O15078 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP290O15078 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP290O15078 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP290O15078 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CEP290O15078 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CEP290O15078 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CEP290O15078 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CEP290O15078 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CEP290O15078 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CEP290O15078 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CEP290O15078 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CEP290O15078 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CEP290O15078 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CEP290O15078 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CEP290O15078 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CEP290O15078 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP290O15078 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CEP290O15078 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
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