Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLGNO14967 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLGNO14967 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLGNO14967 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLGNO14967 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLGNO14967 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLGNO14967 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLGNO14967 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLGNO14967 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLGNO14967 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLGNO14967 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLGNO14967 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLGNO14967 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLGNO14967 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLGNO14967 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLGNO14967 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLGNO14967 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLGNO14967 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLGNO14967 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLGNO14967 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLGNO14967 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLGNO14967 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLGNO14967 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLGNO14967 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLGNO14967 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLGNO14967 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLGNO14967 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLGNO14967 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLGNO14967 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLGNO14967 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLGNO14967 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLGNO14967 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLGNO14967 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLGNO14967 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLGNO14967 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLGNO14967 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLGNO14967 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLGNO14967 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLGNO14967 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLGNO14967 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLGNO14967 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLGNO14967 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLGNO14967 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLGNO14967 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLGNO14967 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLGNO14967 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLGNO14967 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLGNO14967 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLGNO14967 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLGNO14967 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLGNO14967 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLGNO14967 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLGNO14967 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLGNO14967 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLGNO14967 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLGNO14967 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLGNO14967 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLGNO14967 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLGNO14967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLGNO14967 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLGNO14967 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLGNO14967 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLGNO14967 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLGNO14967 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLGNO14967 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLGNO14967 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLGNO14967 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLGNO14967 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLGNO14967 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLGNO14967 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLGNO14967 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLGNO14967 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLGNO14967 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLGNO14967 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLGNO14967 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLGNO14967 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLGNO14967 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLGNO14967 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLGNO14967 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLGNO14967 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLGNO14967 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLGNO14967 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLGNO14967 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLGNO14967 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLGNO14967 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLGNO14967 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLGNO14967 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLGNO14967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLGNO14967 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLGNO14967 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLGNO14967 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLGNO14967 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLGNO14967 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLGNO14967 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLGNO14967 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLGNO14967 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLGNO14967 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLGNO14967 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLGNO14967 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLGNO14967 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms