Protein–RNA interactions for Protein: O14966

RAB29, Ras-related protein Rab-7L1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB29O14966 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB29O14966 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB29O14966 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB29O14966 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB29O14966 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB29O14966 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB29O14966 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB29O14966 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB29O14966 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB29O14966 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB29O14966 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB29O14966 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB29O14966 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB29O14966 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB29O14966 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB29O14966 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB29O14966 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB29O14966 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB29O14966 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB29O14966 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB29O14966 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB29O14966 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB29O14966 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB29O14966 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB29O14966 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB29O14966 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB29O14966 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB29O14966 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB29O14966 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB29O14966 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB29O14966 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB29O14966 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB29O14966 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB29O14966 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB29O14966 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB29O14966 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB29O14966 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB29O14966 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB29O14966 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB29O14966 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB29O14966 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB29O14966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB29O14966 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB29O14966 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB29O14966 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB29O14966 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB29O14966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB29O14966 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB29O14966 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB29O14966 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB29O14966 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB29O14966 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB29O14966 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB29O14966 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB29O14966 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB29O14966 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB29O14966 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB29O14966 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB29O14966 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB29O14966 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB29O14966 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB29O14966 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB29O14966 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB29O14966 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB29O14966 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB29O14966 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB29O14966 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB29O14966 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB29O14966 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB29O14966 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB29O14966 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB29O14966 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB29O14966 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB29O14966 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB29O14966 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB29O14966 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB29O14966 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB29O14966 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB29O14966 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB29O14966 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB29O14966 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB29O14966 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB29O14966 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB29O14966 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB29O14966 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB29O14966 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB29O14966 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB29O14966 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB29O14966 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB29O14966 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB29O14966 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB29O14966 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB29O14966 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB29O14966 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB29O14966 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB29O14966 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB29O14966 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB29O14966 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB29O14966 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB29O14966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms