Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LIN7AO14910 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LIN7AO14910 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LIN7AO14910 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LIN7AO14910 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIN7AO14910 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LIN7AO14910 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LIN7AO14910 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIN7AO14910 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIN7AO14910 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIN7AO14910 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIN7AO14910 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LIN7AO14910 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LIN7AO14910 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIN7AO14910 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIN7AO14910 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LIN7AO14910 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LIN7AO14910 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN7AO14910 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LIN7AO14910 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LIN7AO14910 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LIN7AO14910 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LIN7AO14910 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN7AO14910 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIN7AO14910 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIN7AO14910 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN7AO14910 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIN7AO14910 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIN7AO14910 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LIN7AO14910 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIN7AO14910 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN7AO14910 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN7AO14910 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN7AO14910 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN7AO14910 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN7AO14910 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIN7AO14910 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIN7AO14910 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN7AO14910 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN7AO14910 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN7AO14910 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN7AO14910 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN7AO14910 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIN7AO14910 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIN7AO14910 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms