Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC9O14530 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC9O14530 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNDC9O14530 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC9O14530 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC9O14530 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TXNDC9O14530 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXNDC9O14530 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TXNDC9O14530 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TXNDC9O14530 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TXNDC9O14530 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TXNDC9O14530 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TXNDC9O14530 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TXNDC9O14530 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXNDC9O14530 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC9O14530 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNDC9O14530 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNDC9O14530 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXNDC9O14530 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNDC9O14530 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNDC9O14530 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC9O14530 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC9O14530 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TXNDC9O14530 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNDC9O14530 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXNDC9O14530 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TXNDC9O14530 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TXNDC9O14530 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TXNDC9O14530 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TXNDC9O14530 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TXNDC9O14530 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNDC9O14530 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC9O14530 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TXNDC9O14530 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms