Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID1AO14497 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID1AO14497 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID1AO14497 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID1AO14497 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID1AO14497 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID1AO14497 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID1AO14497 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1AO14497 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1AO14497 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1AO14497 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID1AO14497 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID1AO14497 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID1AO14497 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1AO14497 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID1AO14497 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1AO14497 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1AO14497 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1AO14497 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID1AO14497 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID1AO14497 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID1AO14497 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID1AO14497 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID1AO14497 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1AO14497 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1AO14497 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID1AO14497 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID1AO14497 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID1AO14497 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID1AO14497 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID1AO14497 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID1AO14497 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID1AO14497 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1AO14497 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms