Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2CO00762 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2CO00762 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2CO00762 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2CO00762 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBE2CO00762 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2CO00762 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2CO00762 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2CO00762 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2CO00762 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2CO00762 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2CO00762 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2CO00762 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2CO00762 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2CO00762 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2CO00762 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms