Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGRPO00253 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGRPO00253 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AGRPO00253 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGRPO00253 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGRPO00253 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGRPO00253 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AGRPO00253 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGRPO00253 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGRPO00253 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGRPO00253 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGRPO00253 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGRPO00253 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGRPO00253 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGRPO00253 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGRPO00253 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGRPO00253 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AGRPO00253 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AGRPO00253 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGRPO00253 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGRPO00253 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGRPO00253 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AGRPO00253 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGRPO00253 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGRPO00253 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGRPO00253 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGRPO00253 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGRPO00253 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGRPO00253 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGRPO00253 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGRPO00253 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AGRPO00253 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGRPO00253 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGRPO00253 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGRPO00253 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGRPO00253 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGRPO00253 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGRPO00253 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGRPO00253 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGRPO00253 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGRPO00253 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGRPO00253 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGRPO00253 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGRPO00253 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGRPO00253 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGRPO00253 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGRPO00253 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGRPO00253 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGRPO00253 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGRPO00253 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AGRPO00253 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGRPO00253 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGRPO00253 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGRPO00253 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGRPO00253 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGRPO00253 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AGRPO00253 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGRPO00253 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGRPO00253 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGRPO00253 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AGRPO00253 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGRPO00253 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGRPO00253 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AGRPO00253 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AGRPO00253 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGRPO00253 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGRPO00253 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGRPO00253 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGRPO00253 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGRPO00253 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGRPO00253 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGRPO00253 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGRPO00253 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGRPO00253 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGRPO00253 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGRPO00253 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGRPO00253 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGRPO00253 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGRPO00253 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AGRPO00253 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGRPO00253 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGRPO00253 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGRPO00253 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGRPO00253 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AGRPO00253 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGRPO00253 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGRPO00253 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGRPO00253 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGRPO00253 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGRPO00253 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGRPO00253 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGRPO00253 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGRPO00253 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGRPO00253 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGRPO00253 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGRPO00253 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGRPO00253 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGRPO00253 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AGRPO00253 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGRPO00253 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms