Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KT08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3KT08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KT08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3KT08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3KT08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KT08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3KT08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3KT08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3KT08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KT08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KT08 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KT08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KT08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KT08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KT08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KT08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KT08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KT08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KT08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KT08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KT08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KT08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KT08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3KT08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3KT08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KT08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
J3KT08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
J3KT08 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
J3KT08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KT08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KT08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KT08 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KT08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KT08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KT08 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KT08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KT08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KT08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KT08 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KT08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KT08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KT08 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KT08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KT08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KT08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KT08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KT08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KT08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KT08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KT08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KT08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KT08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KT08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KT08 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
J3KT08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
J3KT08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KT08 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KT08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KT08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
J3KT08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
J3KT08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KT08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
J3KT08 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KT08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KT08 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KT08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
J3KT08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
J3KT08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KT08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
J3KT08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
J3KT08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
J3KT08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KT08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
J3KT08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3KT08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KT08 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KT08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3KT08 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KT08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KT08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3KT08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3KT08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3KT08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3KT08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3KT08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3KT08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KT08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KT08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KT08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3KT08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KT08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KT08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KT08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3KT08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3KT08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KT08 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KT08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KT08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KT08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms